Lima v 7.11.0. Disabling (default) writes in mli format. Cmake suppor…

CMakeLists.txt

@@ -18,6 +18,7 @@ option (SUMESH "Utilisation de la bibliothèque de sumesh." ON)
 
 # Les formats de fichiers optionnellement supportés :
 option (FORMAT_MLI "Format obsolète déconseillé en externe. Requiert HDF145." ON)
+option (WRITER_MLI "Ecrivain du format obsolète. Requiert FORMAT_MLI." FALSE)
 option (FORMAT_MLI2 "Format remplaçant le format MLI recommandé partout. Requiert HDF 5 v >= 1.10.0." ON)
 
 # Binaires optionnels :

cmake/version.cmake

@@ -3,8 +3,8 @@
 #
 
 set (LIMA_MAJOR_VERSION "7")
-set (LIMA_MINOR_VERSION "10")
-set (LIMA_RELEASE_VERSION "3")
+set (LIMA_MINOR_VERSION "11")
+set (LIMA_RELEASE_VERSION "0")
 set (LIMA_VERSION ${LIMA_MAJOR_VERSION}.${LIMA_MINOR_VERSION}.${LIMA_RELEASE_VERSION})
 
 

installation.txt

@@ -8,6 +8,8 @@ Elle requiert une version supérieure ou égale à la version 3.20.0 de cmake. L
 CONFIGURATION DE BASE : lecteurs mali mli mli2 ideas gibi castem modulef [icemcfd] dyna2d dyna3d abaqus
 =======================
 
+A noter qu'à partir de la version 7.11.0 l'écrivain mli est désactivé.
+
 
 Exemples de compilation/installation : 
 
@@ -20,7 +22,7 @@ cmake -DCMAKE_C_COMPILER=/usr/bin/gcc -DCMAKE_CXX_COMPILER=/usr/bin/g++ -DCMAKE_
       -DCMAKE_BUILD_TYPE:STRING=Release -DCMAKE_VERBOSE_MAKEFILE=ON -DBUILD_XLMLIMA=ON -DBUILD_TESTS:BOOL=ON -DBUILD_SCRIPTING:BOOL=ON -DMACHINE_TYPES:BOOL=OFF -DSUMESH:BOOL=OFF -DFORMAT_MLI:BOOL=OFF -DFORMAT_MLI2:BOOL=ON -DFORMAT_MLI2:BOOL=ON \
       -DBUILD_SHARED_LIBS:BOOL=ON -DINT_8:BOOL=ON -DREAL_8:BOOL=ON \
       -DSWIG_EXECUTABLE=/opt/swig/4.1.1/bin/swig -DPython2_ROOT_DIR=/usr/lib/python2.7 -DHDF5_ROOT=/opt/HDF5/1.12.0  \
-      -B /tmp/lima_build_dir -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/Lima/7.10.3
+      -B /tmp/lima_build_dir -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/Lima/7.11.0
 cmake --build /tmp/lima_build_dir
 cmake --install /tmp/lima_build_dir
 
@@ -30,7 +32,7 @@ cmake -DCMAKE_C_COMPILER=/usr/bin/gcc -DCMAKE_CXX_COMPILER=/usr/bin/g++ -DCMAKE_
       -DCMAKE_BUILD_TYPE:STRING=Release -DCMAKE_VERBOSE_MAKEFILE=ON -DBUILD_XLMLIMA=ON -DBUILD_TESTS:BOOL=ON -DBUILD_SCRIPTING:BOOL=ON -DMACHINE_TYPES:BOOL=ON -DSUMESH:BOOL=ON -DFORMAT_MLI:BOOL=ON -DFORMAT_MLI2:BOOL=ON \
       -DBUILD_SHARED_LIBS:BOOL=ON -DINT_8:BOOL=ON -DREAL_8:BOOL=ON \
       -DSWIG_EXECUTABLE=/opt/swig/4.1.1/bin/swig -DPython2_ROOT_DIR=/usr/lib/python2.7 -DHDF5_ROOT=/opt/HDF5/1.12.0 -DHDF145_INCLUDE_DIR=/opt/hdf145/1.3.0/include -DHDF145CPP_LIBRARY=/opt/hdf145/1.3.0/lib/libhdf145_cpp.so -DHDF145_LIBRARY=/opt/hdf145/1.3.0/lib/libhdf145.so \
-      -B /tmp/lima_build_dir -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/Lima/7.10.3
+      -B /tmp/lima_build_dir -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/Lima/7.11.0
 cmake --build /tmp/lima_build_dir
 cmake --install /tmp/lima_build_dir
 
@@ -51,6 +53,7 @@ L'option -DMACHINE_TYPES:BOOL=OFF permet de désactiver l'utilisation de Machine
 L'option -DSUMESH:BOOL=OFF permet de désactiver l'utilisation de la bibliothèque sumesh (lissage).
 
 L'option -DFORMAT_MLI:BOOL=OFF permet de désactiver le lecteur/écrivain obsolète "mli" qui repose sur la bibliothèque HDF 5 1.4.5.
+L'option -DWRITER_MLI:BOOL=ON permet de réactiver l'écrivain obsolète "mli" à condition que FORMAT_MLI soit positionné à ON.
 L'option -DDISABLE_MLI_WARNING:BOOL=ON, fortement déconseillée, permet de désactiver l'affichage en bleu dans la console d'un avertissement signalant l'utilisation de ce lecteur/écrivain obsolète "mli".
 
 L'option -DFORMAT_MLI2:BOOL=OFF permet de désactiver le lecteur/écrivain "mli2" qui repose sur une version supérieure ou égale à 1.10.0 de la bibliothèque HDF 5.

src/Lima/CMakeLists.txt

@@ -46,6 +46,9 @@ if (${HDF145_FOUND})
 	message (STATUS "======================> Ajout du support du format mli")
 	list (APPEND EXTERNAL_LIBS_FLAGS "HDF5_1_4_3")
 	list (APPEND EXTERNAL_LIBS_FLAGS "-D__INTERNE_MALIPP")
+	if (WRITER_MLI)
+		list (APPEND EXTERNAL_LIBS_FLAGS "-D__INTERNE_MALIPP_WRITER")
+	endif (WRITER_MLI)
 	target_link_libraries (Lima PUBLIC HDF145::hdf145_cpp)
 	set (MLI_SUPPORTED ON)
 endif (${HDF145_FOUND})

src/Lima/apic.cpp

@@ -15,7 +15,7 @@
 #include "LimaP/maillage_it.h"
 #include <Lima/maillage.h>
 
-#ifdef __INTERNE_MALIPP
+#if defined(__INTERNE_MALIPP) && defined (__INTERNE_MALIPP_WRITER)
 #include <Lima/malipp.h>
 #endif	/* __INTERNE_MALIPP */
 
@@ -1020,8 +1020,7 @@ int LM_ecrire_maillage(LM_MAILLAGE *maillage, LM_FORMAT_FICHIER format,
   return 0;
 }
 
-
-#ifdef __INTERNE_MALIPP
+#if defined(__INTERNE_MALIPP) && defined (__INTERNE_MALIPP_WRITER)
 int LM_compression_zlib_malipp (int comprimer, int niveau)
 {
 	try

src/Lima/apif.cpp

@@ -29,7 +29,7 @@
 #include "LimaP/fonction.h"
 #include "LimaP/algorithme.h"
 
-#ifdef __INTERNE_MALIPP
+#if defined(__INTERNE_MALIPP) && defined (__INTERNE_MALIPP_WRITER)
 #include <Lima/malipp.h>
 #endif	// __INTERNE_MALIPP
 
@@ -2899,7 +2899,7 @@ void Init_attribut(_MaillageInterne* mai, att_loc pt_attach, string nom_groupe)
 }
 
 
-#ifdef __INTERNE_MALIPP
+#if defined(__INTERNE_MALIPP) && defined (__INTERNE_MALIPP_WRITER)
 void lmczmli_ (int_type* comprimer, int_type* niveau, int_type* ier)
 {
 	try

src/Lima/malipp.cpp

@@ -90,8 +90,7 @@ HDFAttributeDescriptor::HDFAttributeDescriptor ( )
 }	// HDFAttributeDescriptor::HDFAttributeDescriptor
 
 
-HDFAttributeDescriptor::HDFAttributeDescriptor (
-										const HDFAttributeDescriptor& ad)
+HDFAttributeDescriptor::HDFAttributeDescriptor (const HDFAttributeDescriptor& ad)
 {
 	for (size_type i = 0; i < ATTRIBUT_SIZE; i++)
 		m_name [i]	= ad.m_name [i];
@@ -100,8 +99,7 @@ HDFAttributeDescriptor::HDFAttributeDescriptor (
 }	// HDFAttributeDescriptor::HDFAttributeDescriptor
 
 
-HDFAttributeDescriptor& HDFAttributeDescriptor::operator = (
-										const HDFAttributeDescriptor& ad)
+HDFAttributeDescriptor& HDFAttributeDescriptor::operator = (const HDFAttributeDescriptor& ad)
 {
 	if (&ad != this)
 	{
@@ -144,8 +142,7 @@ MaliPPReader::GroupeReader::GroupeReader (const GroupeReader& reader)
 }	// GroupeReader::GroupeReader
 
 
-MaliPPReader::GroupeReader& MaliPPReader::GroupeReader::operator = (
-													const GroupeReader& reader)
+MaliPPReader::GroupeReader& MaliPPReader::GroupeReader::operator = (const GroupeReader& reader)
 {
 	if (&reader != this)
 	{
@@ -1928,6 +1925,8 @@ void MaliPPReader::lire_composition_maillage ( )
 //                            LA CLASSE MaliPPWriter
 // ===========================================================================
 
+#ifdef __INTERNE_MALIPP_WRITER
+
 static size_t computeChunkSize (size_t count, size_t elementSize)
 {
 // Pour forcer la creation de blocs lors de tests :
@@ -1975,7 +1974,7 @@ MaliPPWriter::MaliPPWriter (const IN_STD string& nom_fichier, size_type num)
 
 }	// MaliPPWriter::MaliPPWriter
 
-void MaliPPWriter::beginWrite()
+void MaliPPWriter::beginWrite ( )
 {
 	bool			throwExc	= false;
 	MutableString	errorMsg;
@@ -2496,12 +2495,7 @@ void MaliPPWriter::writeNodesInfo (bool isContiguous, id_type nbNodes, id_type f
 }	// MaliPPWriter::writeNodesInfo
 
 
-void MaliPPWriter::writeNodes (
-		id_type nodesChunkSize,
-		double* coordsX,
-		double* coordsY,
-		double* coordsZ,
-		id_type* ids)
+void MaliPPWriter::writeNodes (id_type nodesChunkSize, double* coordsX, double* coordsY, double* coordsZ, id_type* ids)
 {
 	BEGIN_TRY_CATCH_BLOCK("MaliPPWriter::writeNodes ")
 
@@ -2602,10 +2596,7 @@ void MaliPPWriter::writeNodeSetInfo (id_type nbSet, std::vector<std::string> set
 }  // MaliPPWriter::writeNodeSetInfo
 
 
-void MaliPPWriter::writeNodeSetData (
-		std::string name,
-		id_type chunkSize,
-		id_type* ids)
+void MaliPPWriter::writeNodeSetData (std::string name, id_type chunkSize, id_type* ids)
 {
 	BEGIN_TRY_CATCH_BLOCK("MaliPPWriter::writeNodeSetData ")
 
@@ -2819,10 +2810,7 @@ void MaliPPWriter::writeEdgeSetInfo (id_type nbSet, std::vector<std::string> set
 }  // MaliPPWriter::writeEdgeSetInfo
 
 
-void MaliPPWriter::writeEdgeSetData (
-		std::string name,
-		id_type chunkSize,
-		id_type* ids)
+void MaliPPWriter::writeEdgeSetData (std::string name, id_type chunkSize, id_type* ids)
 {
 	BEGIN_TRY_CATCH_BLOCK("MaliPPWriter::writeEdgeSetData ")
 
@@ -3067,10 +3055,7 @@ void MaliPPWriter::writeFaceSetInfo (id_type nbSet, std::vector<std::string> set
 }  // MaliPPWriter::writeFaceSetInfo
 
 
-void MaliPPWriter::writeFaceSetData (
-		std::string name,
-		id_type chunkSize,
-		id_type* ids)
+void MaliPPWriter::writeFaceSetData (std::string name, id_type chunkSize, id_type* ids)
 {
 	BEGIN_TRY_CATCH_BLOCK("MaliPPWriter::writeFaceSetData ")
 
@@ -3100,11 +3085,7 @@ void MaliPPWriter::writeFaceSetData (
 }  // MaliPPWriter::writeFaceSetData
 
 
-void MaliPPWriter::writeFaceSetData (
-		std::string name,
-		id_type chunkSize,
-		id_type* ids,
-		id_type* nbNodesPerFace)
+void MaliPPWriter::writeFaceSetData (std::string name, id_type chunkSize, id_type* ids, id_type* nbNodesPerFace)
 {
 	BEGIN_TRY_CATCH_BLOCK("MaliPPWriter::writeFaceSetData ")
 
@@ -3368,10 +3349,7 @@ void MaliPPWriter::writeRegionSetInfo (id_type nbSet, std::vector<std::string> s
 }  // MaliPPWriter::writeRegionSetInfo
 
 
-void MaliPPWriter::writeRegionSetData (
-		std::string name,
-		id_type chunkSize,
-		id_type* ids)
+void MaliPPWriter::writeRegionSetData (std::string name, id_type chunkSize, id_type* ids)
 {
 	BEGIN_TRY_CATCH_BLOCK("MaliPPWriter::writeRegionSetData ")
 
@@ -3401,11 +3379,7 @@ void MaliPPWriter::writeRegionSetData (
 }  // MaliPPWriter::writeRegionSetData
 
 
-void MaliPPWriter::writeRegionSetData (
-		std::string name,
-		id_type chunkSize,
-		id_type* ids,
-		Lima::Polyedre::PolyedreType* regionTypes)
+void MaliPPWriter::writeRegionSetData (std::string name, id_type chunkSize, id_type* ids, Lima::Polyedre::PolyedreType* regionTypes)
 {
 	BEGIN_TRY_CATCH_BLOCK("MaliPPWriter::writeRegionSetData ")
 
@@ -3511,8 +3485,7 @@ void MaliPPWriter::writeRegionSetsAttributes ( )
 }  // MaliPPWriter::writeRegionSetsAttributes
 
 
-void MaliPPWriter::writeComposition (const Composition& composition,
-									const std::string& name, CommonFG& root)
+void MaliPPWriter::writeComposition (const Composition& composition, const std::string& name, CommonFG& root)
 {
 	BEGIN_TRY_CATCH_BLOCK("MaliPPWriter::writeComposition ")
 
@@ -3594,6 +3567,7 @@ void MaliPPWriter::activer_compression_zlib (int niveau)
 	HDFHelper::activateZlibCompression (niveau);
 }	// MaliPPWriter::activer_compression_zlib
 
+#endif	// __INTERNE_MALIPP_WRITER
 
 
 // ===========================================================================
@@ -3614,15 +3588,13 @@ HDFAttributeDescriptorType::HDFAttributeDescriptorType ( )
 }	// HDFAttributeDescriptorType::HDFAttributeDescriptorType
 
 
-HDFAttributeDescriptorType::HDFAttributeDescriptorType (
-									const HDFAttributeDescriptorType& at)
+HDFAttributeDescriptorType::HDFAttributeDescriptorType (const HDFAttributeDescriptorType& at)
 	: CompType (at)
 {
 }	// HDFAttributeDescriptorType copy constructor
 
 
-HDFAttributeDescriptorType& HDFAttributeDescriptorType::operator = (
-									const HDFAttributeDescriptorType&)
+HDFAttributeDescriptorType& HDFAttributeDescriptorType::operator = (const HDFAttributeDescriptorType&)
 {
 	return *this;
 }	// HDFAttributeDescriptorType::operator =

src/Lima/public/Lima/malipp.h

@@ -1124,8 +1124,7 @@ class MaliPPReader
 
 
 /**
- * Classe décrivant la structure HDFAttributeDescriptor pour le stockage
- * sous HDF.
+ * Classe décrivant la structure HDFAttributeDescriptor pour le stockage sous HDF.
  */
 class HDFAttributeDescriptorType : public IN_H5 CompType
 {
@@ -1145,9 +1144,10 @@ class HDFAttributeDescriptorType : public IN_H5 CompType
 };	// class HDFAttributeDescriptorType
 
 
+#ifdef __INTERNE_MALIPP_WRITER
+
 /**
- * Classe ne permettant dans la version courrante que d'influer sur la
- * compression des données écrites par HDF5.
+ * Classe ne permettant dans la version courrante que d'influer sur la compression des données écrites par HDF5.
  *
  * NE PAS UTILISER L'API D'ECRITURE
  *
@@ -1157,8 +1157,7 @@ class MaliPPWriter
 	public :
 
 	/**
-	 * Constructeur. Ouvre le fichier en écriture et écrit les données
-	 * générales du maillage.
+	 * Constructeur. Ouvre le fichier en écriture et écrit les données générales du maillage.
 	 * @param		Nom du fichier
 	 * @param		numéro du maillage dans le fichier
 	 * @exception	Une exception est levée en cas d'erreur
@@ -1259,8 +1258,7 @@ class MaliPPWriter
 
 	void		 writeMeshAttributes ( );
 
-	void writeComposition (const Composition& composition, const std::string& name,
-	                                      HDF145::CommonFG& compositionGroup);
+	void writeComposition (const Composition& composition, const std::string& name, HDF145::CommonFG& compositionGroup);
 
 	/**
 	 * Constructeurs et destructeur : interdits.
@@ -1385,6 +1383,7 @@ class MaliPPWriter
 
 };	// class MaliPPWriter
 
+#endif	// __INTERNE_MALIPP_WRITER
 
 #ifndef SWIG
 END_NAMESPACE_LIMA

src/Lima/public/LimaP/reader_malipp.h

@@ -92,6 +92,8 @@ class _ReaderMalipp : public _Reader {
 };
 
 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+#ifdef __INTERNE_MALIPP_WRITER
+
 class _WriterMalipp : public _Writer {
 public :
   _WriterMalipp(_MaillageInterne* mesh, 
@@ -165,6 +167,7 @@ public :
 	bool								m_forceZlib;
 };
 
+#endif	// __INTERNE_MALIPP_WRITER
 
 END_NAMESPACE_LIMA
 

src/Lima/reader_malipp.cpp

@@ -1760,6 +1760,8 @@ void _ReaderMalipp::readGroupAttr (
 }	// _ReaderMalipp::readGroupAttr
 
 
+#ifdef __INTERNE_MALIPP_WRITER
+
 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 //! Ecriture de l'indice des elements dans le champ udata
 void  _WriterMalipp::setDataToIndice ( )
@@ -3183,6 +3185,8 @@ void _WriterMalipp::writeComposition (const Composition& composition,
 	compositionAttr.write (compositionAttr.getDataType ( ), detail);
 }	// _WriterMalipp::writeComposition
 
+#endif	// __INTERNE_MALIPP_WRITER
+
 
 static size_t computeChunkSize (size_t count, size_t elementSize)
 {
@@ -3203,6 +3207,7 @@ static size_t computeChunkSize (size_t count, size_t elementSize)
 	return count / (chunkDivider * elementSize);
 }	// computeChunkSize
 
+
 END_NAMESPACE_LIMA
 
 #endif

src/Lima/writer.cpp

@@ -47,7 +47,7 @@ const char* _liste_format_ecriture[]={
 #ifdef __INTERNE_MALI
   (char*) "unf, format de fichier MALI",
 #endif
-#ifdef __INTERNE_MALIPP
+#if defined(__INTERNE_MALIPP) && defined(__INTERNE_MALIPP_WRITER)
   (char*) "mli, format (désuet) de fichier MALI++",
   (char*) "mliz, format (désuet) de fichier MALI++",
 #endif
@@ -115,7 +115,7 @@ _Writer* _Writer::create(_MaillageInterne* mesh,
     writer = new _WriterMali(mesh, nom_fichier, format);
     break;
 #endif
-#ifdef __INTERNE_MALIPP
+#if defined(__INTERNE_MALIPP) && defined(__INTERNE_MALIPP_WRITER)
   case MALIPP:
     writer = new _WriterMalipp(mesh, nom_fichier, format, num, false);
     break;

src/LimaScripting/CMakeLists.txt

@@ -24,6 +24,7 @@ file (GLOB CPP_SOURCES *.i *.cpp)
 # => dans cette version on ne génère que _LimaScripting qui sera utilisé directement depuis les scripts comme par les exécutables.
 set (ALL_TARGETS LimaScripting)
 set_property (SOURCE LimaScripting.i PROPERTY CPLUSPLUS ON)
+set_property (SOURCE LimaScripting.i PROPERTY USE_SWIG_DEPENDENCIES TRUE)
 swig_add_library (LimaScripting TYPE SHARED LANGUAGE PYTHON SOURCES ${CPP_SOURCES})
 cmake_policy (SET CMP0086 NEW)
 set_source_files_properties (LimaScripting.i PROPERTIES SWIG_MODULE_NAME LimaScripting)