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ARTbio/AnalyseGenome

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Analyse des Génomes

Ce repository est utilisé pour la communication avec les étudiants du cours d'Analyse des Génomes

via les issues ou les discussions de GitHub.

Initialement utilisé pour collecter le matériel spécifique du training Galaxy, il ne contient désormais plus que du code "ancien" et non entretenu, car le déploiement de Galaxy pour le cours est réalisé à l'aide du playbook Ansible galaxyXpand qui permet de construire l'image (VMI) d'un marchine virtuelle disponible sur Google Cloud Engine.

En 2025, les étudiant suivent un workflow minimaliste qui les tient éloignés des lignes de commandes. Il consiste simplement à déployer dans leur compte GCE une machine virtuelle, à partir de l'image préalablement préparée et pré-chargée avec toutes les données primaires nécessaires à leurs analyse dans Galaxy.

La documentation de ce déploiement est disponible sur startbio


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A repository for the training material of the course "Analyse des Génomes"

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