#1434 で Vim のバージョンを 8.2.0020 から 9.1.0065 に更新したことにより、HTML に変換後のページで `~`, `>`, `<` などの conceal されている文字が表示されるようになってしまっています。(vimdoc-en でも同じ問題が起きています。) 差分: https://github.com/vim-jp/vimdoc-ja/commit/f500c7f034b7c6f3de56a98888df6c148bbf6b4d カラースキームの更新による影響かもしれません。