docs: fix package API documentation

Author: ycexiao

docs/source/api/diffpy.srreal.example_package.rst

@@ -10,21 +10,142 @@
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-Subpackages
------------
-
-.. toctree::
-   diffpy.srreal.example_package
-
 Submodules
 ----------
 
-|module|
---------
+diffpy.srreal.atomradiitable module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.atomradiitable
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+
+diffpy.srreal.attributes module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.attributes
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.bondcalculator module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.bondcalculator
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.bvparameterstable module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.bvparameterstable
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.bvscalculator module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.bvscalculator
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.eventticker module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.eventticker
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.overlapcalculator module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.overlapcalculator
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.overlapcalculator module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.overlapcalculator
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.pairquantity module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.pairquantity
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.parallel module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.parallel
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.pdfbaseline module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.pdfbaseline
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.pdfcalculator module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.pdfcalculator
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.pdfenvelope module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.pdfenvelope
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.peakprofile module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.peakprofile
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.peakwidthmodel module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.peakwidthmodel
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+diffpy.srreal.scatteringfactortable module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: diffpy.srreal.scatteringfactortable
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
 
-.. |module| replace:: diffpy.srreal.example_submodule module
+diffpy.srreal.sfaverage module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: diffpy.srreal.example_submodule
+.. automodule:: diffpy.srreal.sfaverage
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance: