Ce petit projet est destiné à des étudiants débutants en bioinformatique. Il montre comment utiliser Biopython pour interroger les bases de données du NCBI, télécharger un génome au format GenBank, et le visualiser graphiquement.
- Découvrir l’API Entrez de NCBI avec Biopython
- Comprendre le format GenBank
- Apprendre à extraire et représenter graphiquement des annotations génétiques
- Utiliser des outils modernes et simples comme
dna-features-viewer
Dans cet exemple, on télécharge le génome mitochondrial complet de Mammuthus primigenius (le mammouth laineux) depuis NCBI et on affiche les gènes sous forme de carte linéaire.
